O Laboratório HERCULES , criado em 2009, é uma infraestrutura de investigação da Universidade de Évora dedicada ao estudo e valorização do património cultural, com especial enfase na integração de metodologias das ciências físicas e dos materiais em abordagens interdisciplinares
O CIDEHUS é um centro de investigação em História, Humanidades e Ciências Sociais.
O seu projeto estratégico para 2015-2020 tem como fulcro a análise das mudanças societais na longa duração.
O Instituto de Ciências da Terra (ICT) é uma unidade de investigação constituída em 2014 com Pólos nas universidades de Évora, Minho (Braga) e Porto e composta por uma equipa multidisciplinar, com diferentes competências que se complementam na área de Ciências da Terra
O Centro de Estudos e de Formação Avançada em Gestão e Economia (CEFAGE), atualmente inclui 50 investigadores integrados, que se repartem pela sede na Universidade de Évora e por pólos na Universidade do Algarve, Universidade da Beira Interior e Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa.
Algumas sinergias científicas de 2015 – fazendo pontes na «Metrópole para o Atlântico»
A Cátedra “Rui Nabeiro” Biodiversidade foi criada no final de 2008, numa parceria entre a empresa Delta Cafés e a Universidade de Évora, com o intuito de apoiar o desenvolvimento científico, a promoção da formação avançada e a divulgação científica no domínio da biodiversidade e das alterações climáticas.