Os objectivos principais do projecto Inno Indigo são:

• Criar novas abordagens à inovação: envolvimento de PME's/indústrias, clusters, redes de excelência e pólos de competitividade;
• Unir esforços para apoiar a "inovação" com abordagem às "regiões" da Europa e da Índia como parceiros de financiamento;
• Disponibilizar orçamento para a investigação: a rede focar-se-á em motivar as organizações de financiamento da Europa e da Índia, para participarem no lançamento de concursos conjuntos;
• Abrir os programas bilaterais de cooperação em ciência, tecnologia e inovação, no sentido de promover o financiamento multilateral, possibilitando a inclusão de parceiros adicionais de acordo com o modelo da Iniciativa Piloto Indiana do Fórum Estratégico para a Cooperação Internacional em Ciência, Tecnologia e Inovação;
• Ganhar visibilidade: Inno Indigo será bem sucedido quando se tornar uma plataforma comum para as organizações financiadoras da Europa e India, de modo a financiarem em conjunto investigação e inovação, especialmente para os países da União Europeia que não têm Acordos Bilaterais com a Índia e desenvolver visões sobre novas formas de colaboração;
• Operacionalizar decisões políticas: Inno Indigo irá colocar em ação as decisões políticas emanadas de diferentes fora (UE-EM, Índia Governo, Regiões, Associações de PME's, Fórum Estratégico para a Cooperação Internacional e o Grupo de Altos Funcionários) em mecanismos práticos e tangíveis de financiamento.